本校於民國二年創辦於沙美張氏祠堂。民國四，成立第四區第一國民學校。民國廿二年由地方熱心人士籌款興建校舍，定名為「金砂學校」，民國廿六年 因對日抗戰而停辦。

民國卅五年復校，改名為「金門縣金沙中心國校」，民國卅八年私立「汶浦小學」併入。五十四年奉令附設幼稚園，五十七年改名為「金門縣金沙鎮金沙國民小學」迄今。

原有校舍因受天然條件限制，無法加以擴建新校舍，並由地方熱方人士捐地及募款配合，於民國五十九年八月新校舍落成，同年遷入現址（金門縣金沙鎮汶沙里后浦頭一一七號）至今，同年幼稚園遷併校本部。